Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB1P16220 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB1P16220 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms