Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRF1P14222 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRF1P14222 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRF1P14222 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms