Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX6A1P12074 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms