Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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UBL4AP11441 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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