Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms