Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM225BP0DP42 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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