Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD3P0DMS9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms