Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC159P0C7I6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms