Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms