Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POP4O95707 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POP4O95707 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POP4O95707 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POP4O95707 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POP4O95707 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms