Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX6O95503 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX6O95503 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms