Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms