Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms