Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DENRO43583 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DENRO43583 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DENRO43583 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms