Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms