Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms