Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms