Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HACD1B0YJ81 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms