Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms