Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
A4D1N5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
A4D1N5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
A4D1N5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms