Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms