Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP3Q9Y6F1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms