Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms