Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX7Q9UNH6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms