Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRF3Q9ULT6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms