Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms