Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNA3Q9UI47 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms