Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms