Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDP1Q9P0J1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms