Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COMMD9Q9P000 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COMMD9Q9P000 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COMMD9Q9P000 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COMMD9Q9P000 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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COMMD9Q9P000 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD9Q9P000 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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