Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATAD3AQ9NVI7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms