Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHST12Q9NRB3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms