Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX9Q9NQ69 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms