Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms