Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTMR12Q9C0I1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms