Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms