Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIPCQ9C0C6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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