Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP1Q9C000 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms