Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM55Q9BYV6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms