Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms