Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLVAPQ9BX97 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms