Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RSG1Q9BU20 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RSG1Q9BU20 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms