Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms