Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD5Q99717 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms