Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGMNQ99538 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms