Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNN2Q99439 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms