Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms