Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms