Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms