Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNRIP1Q96F85 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms